Ich habe nochmal mit Habemus_Papam_20.04.06_20-15_arte_100_TVOON_DE.mpg.HD.test.avi (Cutlist mit ein paar Pausen an bekannter Stelle zur Verfügung gestellt) getestet.
Schneiden mit Cut Assistant (0.19.4.23 und 0.9.12.2) und Cutana 0.9.2.2 (mit Win7, VirtualDub 1.7.8 und x264vfw 2200bm) hat problemlos geklappt, und die Schnittstellen waren auch auf 2 Hardwareplayern ohne Störungen abspielbar.